Takaisin ylös
Pirkanmaa ja Kanta-Häme:

cKIT-GEENIN D816V -MUTAATION OSOITUS

 Tulostusversio Pysyvä linkki ohjeen hyväksyttyyn versioon

Luokitus: Alihankittavat Genetiikka
Versio: 1.1
Tila: Hyväksytty
Laatimispvm: 22.12.2016
Hyväksymispvm: 09.06.2017
Käyttöönottopvm: 22.12.2016

Atk-numero Lyhenne Kommentti
92502  Bm-KIT816   

Johdanto

KIT-proto-onkogeeni (c-KIT) sijaitsee kromosomissa 4q12 ja se koodaa luokan III transmebraanista reseptorityrosiinikinaasia (CD117). c-KIT-geenin mutaatiot voivat aiheuttaa reseptorin konstitutiivisen aktivaation. Mutaatiot sijoittuvat erityisesti kinaasialayksikköä koodaavaan eksoniin 17, mutta myös muihin eksoneihin. c-KIT-geenin aktivoivia mutaatioita tavataan useassa eri taudissa, mm. systeemisessä mastosytoosissa sekä akuutissa myelooisessa leukemiassa (CBF-AML).

Suurimmasta osasta aikuisiän syteemistä mastosytoosia sairastavista voidaan löytää c-KIT-geenin aktivoiva D816V-pistemutaatio. Se luetaankin yhdeksi WHO:n kriteeriksi systeemisen mastosytoosin diagnosoinnissa. Mastosytoosiin liittyvän D816V-mutaation osoituksessa on tärkeää käyttää herkkää mutaationosoitustekniikkaa, koska klonaalisten mastosyyttien osuus luuydinaspiraatissa voi olla vain 1-2 %:n luokkaa. Tässä tutkimuksessa mastosytoosipotilaan analyysissä käytetään ns. ACB-PCR-menetelmää (allele-specific competitive blocker), jolla voidaan osoittaa c-KIT-geenin D816V-mutaatio jopa 0.1 %:n herkkyystasolla.

Tiedustelut

Sairaalageneetikot puh. 03-311 75937, 050-347 6382

Indikaatiot

Systeemisen mastosytoosin diagnostiikka (herkistetty menetelmä c-KIT -geenin D816V -mutaation osoittamiseksi).

Lähete/tutkimuksen tilaaminen

Atk-pyyntö. Mikäli atk-pyyntöä ei ole mahdollista tehdä, täytetään huolellisesti genetiikan lähete, joka löytyy ohjekirjan Lähetteet-kansiosta.

HUOM! Mikäli tutkimus halutaan tehtäväksi jo aikaisemmin otetusta näytteestä, toimitaan näin: JOTTA PYYNTÖ VÄLITTYY GENETIIKAN LABORATORIOON tulee WebFimlabissa vaihtaa Näytteenotto -kohtaan "Näytteenotto heti, tulosta tarrat". Tarroja ei kuitenkaan tarvitse tulostaa laboratoriota varten.

Näyte

Luuydin: Sitraattiruiskulla n. 3 ml luuydintä CPT-putkeen (suositeltava putkityyppi: BD Vacutainer CPT with Sodium Citrate, 4 mL draw capacity).

Näytteen säilytys, kuljetus ja esikäsittely

Luuydin: näyte sentrifugoidaan (30 min, 1600 g, huoneenlämpö 18-25 C) kahden tunnin sisällä näytteenotosta. Sentrifugoinnin jälkeen käännetään avaamaton putki 5-10 kertaa ylösalaisin. Putket voidaan lähettää huoneenlämmössä normaalina yön yli postina.
Kudos: Näyte toimitetaan laboratorioon mahdollisimman nopeasti. Mikäli kudosnäyte tulee otettavaksi illalla tai viikonloppuna, se säilytetään jääkaapissa ja toimitetaan laboratorioon heti kun mahdollista.

Menetelmä

ACB-PCR (allele-specific competitive blocker) D816V-mutaation osoittamiseksi.

Tulos valmiina

Tutkimusta tehdään tarvittaessa.

Tulkinta

Tutkimuksesta annetaan lausunto.


Alihankinta:
Kyllä